• 劉喜朋

    副教授

    • 電話:+86-021-34204378
    • 郵箱:xpliu@sjtu.edu.cn
    • 地址:生物藥學樓3號樓207

    學術經歷

    • 1、受教育經歷
    • 2001/03-2005/06🏕,EON体育4⚒,生命科學與技術EON4,博士學位,導師 劉建華教授。
    • 1998/09-2001/02,天津大學,化工EON4生物化工系,碩士學位,導師 元英進教授。
    • 1994/09-1998/07🦿🪡,天津大學,化工EON4生物化工系💬,學士學位,導師 元英進教授🐏。
    • 2🖊、工作經歷
    • 2010/06 –今 EON体育4,EON体育4平台👨‍💼,微生物代謝國家重點實驗室🔜🏗,副教授📍。
    • 2008/12 – 2010/05📆,法國國家科學研究中心分子遺傳研究所(CNRS🧛🏼‍♀️, Centre de Genetique Moleculaire),博士後。
    • 2008/01 – 2008/11,EON体育4,EON体育4平台,副教授👮🏻‍♂️。
    • 2005/07 – 2007/12🕯,EON体育4,EON体育4平台𓀇,講師。

    研究方向

    3.極端微生物基因資源挖掘利用

    1)極端微生物重要功能基因的挖掘利用,尤其有重要經濟價值的極端酶。
    2)高通量基因克隆、蛋白表達純化高通量篩選🪟、重組蛋白表達工藝優化🚴‍♀️。

    2.核酸代謝與癌症、分子診斷應用

    1)DNA復製與損傷修復缺陷與癌症易感性之間的關聯機製。

    2)核酸檢測、SNP基因分型、分子診斷與基因編輯技術開發🚵🏿‍♂️,及其在精準用藥🦮、癌症早期診斷🥋、遺傳病與傳染病檢測👳🏽、法醫刑偵、食品致病微生物、寵物疾病檢測中的應用。
     

    1. 極端微生物DNA復製與損傷修復

    1)DNA replisome(復製體)的組裝、動態變化、調控及其在核酸擴增中的應用🔨。

    2)同源重組修復、非同源末端連接修復📳、核苷酸切除修復🧜🏽‍♀️➖、堿基切除修復的分子機製及其在基因組編輯技術中的應用。

    3)CRISPR分子機製及其蛋白在基因編輯、分子診斷中的應用。

    代表論著

    • •  

      Feng L#, Chang CC#, Song D, Jiang C, Song Y, Wang CF, Deng W, Zou YJ, Chen HF, Xiao X, Wang FP, Liu XP*. (2018) The trimeric Hef-associated nuclease HAN is a 3'→5' exonuclease and is probably involved in DNA repair, Nucleic Acids Res. 46(17): 9027–9043.

      •  

      Li MJ, Yi GS, Yu F, Zhou H, Chen JN, Xu CY, Wang FP, Xiao X, He JH*, Liu XP*. (2017) The crystal structure of Pyrococcus furiosus RecJ implicates it as an ancestor of eukaryotic Cdc45, Nucleic Acids Res. 45(21): 12551-12564.

      •  

      Yuan H#, Liu XP #,*, Han Z, Allers T, Hou JL, Liu JH*. (2013) RecJ-like protein from Pyrococcus furiosus has 3’-5’ exonuclease activity on RNA: implication of its proofreading capacity on 3’-mismatched RNA primer in DNA replication, Nucleic Acids Res. 41(11): 5817-5826.

      •  

      Deng YJ, Feng L, Zhou H, Xiao X, Wang FP, Liu XP*. (2018) NanoRNase from Aeropyrum pernix shows nuclease activity on ssDNA and ssRNA, DNA Repair 65(1): 54–63.

      •  

      Xie JJ#, Liu XP#,*, Han Z, Yuan H, Wang Y, Hou JL, Liu JH*. (2013) Chlamydophila pneumoniae endonuclease IV prefers to remove mismatched 3' ribonucleotides: Implication in proofreading mismatched 3'-terminal nucleotides in short-patch repair synthesis, DNA Repair 12(2): 140-147.

    獲獎情況

    • 1)EON体育4晨星青年學者獎勵計劃二等獎📶🖋。
    • 2)全國大學生生命科學創新創業大賽指導教師一等獎。

    教學情況

    • 生物化學(F)🏊🏿,48學時🔷🏃‍♂️‍➡️,本科生💇🏼,主講教師🍠。
    • 高級生化實驗⚖️,32學時,本科生,共同主講教師😏。
    • 1)國家自然科學基金聯合基金項目,U1832161👰🏿‍♂️,決定古菌DHH家族磷酸酯水解酶底物特異性的結構研究,2019年1月-2021年12月➙,54萬✪🥅,在研🧍‍♂️,主持📊。
    • 2)國家重點研發計劃“深海關鍵技術與裝備”重點專項,2018YFC0310700,深海熱液區生物資源研究與應用評價🤦,2018年7月-2021年12月,65萬,在研,子課題負責人。
    • 3)國家重點研發計劃“深海關鍵技術與裝備”重點專項,2018YFC0309800👨🏼‍🦱,海鬥深淵環境特征與生命演化工程🕴🏻,2018年7月-2021年12月,75萬,在研,子課題負責人。
    • 4)國家自然科學基金面上項目𓀑,31371260,古菌RecJ-like核酸酶參與校正RNA引物3'末端錯配核糖核苷酸的分子機製研究,2014年1月-2017年12月,80萬,已結題,主持。
    • 5)上海市自然科學基金,12ZR1413700,古菌A. pernix dU損傷堿基切除修復的生化研究,2012年7月-2015年6月,10萬,已結題,主持。
    • 6)國家自然科學基金青年基金項目,30700131,基於耐高溫mutS蛋白、pfu DNA聚合酶、dU修飾寡核苷酸探針的SNP檢測技術,2008年1月-2010年12月,17萬,已結題🧒🏿,主持。

    承擔項目

    學生培養

    • 在讀學生
    • 畢業學生
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